[Lcefiec] Materia Introduccion a la Biologia Computacional

[Irene Loiseau]

INTRODUCCIÓN A LA BIOLOGÍA COMPUTACIONAL
(Biologia Molecular Computacional)
Materia a dictarse el segundo cuatrimestre de 2004 en el Dpto. de
Computacion, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, UBA

PROFESORA: Irene Loiseau (irene@dc.uba.ar)
JTP y AY1: Cristian Rocha, Rocio Romero Zaliz, Viviana Cotik
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Materia optativa para la Licenciatura en Ciencias de la Computación
y para el doctorado en Ciencias de la Computacion. Abierta a alumnos de
grado y doctorado de otras carreras, especialmente de Biología.
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OBJETIVOS:
El objetivo de la materia es que los alumnos de computación estudien los
algoritmos que se usan para resolver problemas de biología de gran
actualidad, y que los alumnos de biología u otras disciplinas afines,
tengan las nociones básicas de como funcionan los métodos computacionales
que se usan para resolver dichos problemas, cuáles son los que se usan en
los paquetes computacionales más conocidos, y la confiabilidad de los
resultados que los mismos proveen. También es un objetivo importante del
curso el fomentar el trabajo interdisciplinario entre los alumnos.  Parte
de la materia tendrá la estructura de un seminario y muchos de los temas
serán expuestos por los alumnos. Para conseguir uno de los objetivos ya
mencionados de la materia y como ya se hizo en oprotunidades anteriores se
formarán grupos interdisciplinarios de alumnos para las exposiciones y la
presentación de trabajos.
Las nociones básicas de biología necesarias serán presentadas por
estudiantes de biología que quieran participar, o por alguno de los
biólogos que trabajan en colaboración con nuestro grupo en estos temas. Se
dará también una introducción especial a las nociones básicas de
algoritmos para los alumnos de biología y carreras afines.
Se realizarán  trabajos prácticos haciendo algunos desarrollos y usando
paquetes conocidos para estos problemas y bases de datos públicas,
incluídos los que están instalados en nuestro Dpto.

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Temario resumido (mas detalles, bibliografia, etc. ver la pagina WEB):
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- Nociones básicas de algoritmos y complejidad de algoritmos para biólogos
y carreras afines.
- Conceptos básicos de biología molecular para los alumnos de computación.
- Algoritmos y metodos computacionales para:
  .Comparación de secuencias y búsqueda en base de datos
  .Montaje de fragmentos de DNA
  .Mapeo físico de cromosomas
  .Construcción de arboles filogenéticos
  .Determinación de la estructura secundaria y terciaria de proteinas,
  .Reordenamiento de genomas.
  .Análisis de datos de microarray.
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MAS DETALLES EN: http://www.dc.uba.ar/people/materias/biocomp
y/o consultar con la profesora.

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Inscripcion: http://www.inscripciones.fcen.uba.ar  del 26 de julio
al 8 de agosto.
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Irene Loiseau
Departamento de Computación
Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
Universidad de Buenos Aires
Pabellón I Ciudad Universitaria
1428 Buenos Aires ARGENTINA
TE/FAX: 54 11 45763359
TE/FAX: 54 11 457633900/96 int 711
e-mail: irene@dc.uba.ar